RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SMIM18P0DKX4 95 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SRD5A1P18405 259 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 AMY2BP19961 511 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LMO1P25800 156 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 P2RY14Q15391 338 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 HES5Q5TA89 166 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 YIPF6Q96EC8 236 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CHST6Q9GZX3 395 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PPA2Q9H2U2 334 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 BANF2Q9H503 90 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 IFT22Q9H7X7 185 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 MMP26Q9NRE1 261 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DUX4Q9UBX2 424 aa14.82□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 IFITM5A6NNB3 132 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 M0R1W7 72 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 TMEM127O75204 238 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ZNF737O75373 536 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CSN2P05814 226 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SDC2P34741 201 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PDCD1Q15116 288 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 RAB9BQ9NP90 201 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 METRNQ9UJH8 293 aa14.81□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 A0A0G2JK05 382 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 HSPB6O14558 160 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 MXD1Q05195 221 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PAX8Q06710 450 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 TAF9Q16594 264 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 GPR157Q5UAW9 335 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 Q6P435 159 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PHF21AQ96BD5 680 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CENPOQ9BU64 300 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 RAB22AQ9UL26 194 aa14.8□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 TMEM82A0PJX8 343 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 VSIG8P0DPA2 414 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 FUT3P21217 361 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR3A1P47881 315 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 P2RX3P56373 397 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ARF6P62330 175 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 GUCA2AQ02747 115 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LYPD6Q86Y78 171 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 Q96M66 194 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 ZNF714Q96N38 554 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 WDFY2Q96P53 400 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.79□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 A0A1W2PP11 408 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PSPNO60542 156 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CRLF1O75462 422 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SCGNO76038 276 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 IFNA2P01563 188 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 GLAP06280 429 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CD37P11049 281 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 FPR2P25090 351 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 CFPP27918 469 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR10A3P58181 314 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 PAX2Q02962 417 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 RAB12Q6IQ22 244 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.78□□□□□ -0.04
BRF1-209ENST00000547052 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms