RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 C11orf88Q6PI97 169 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TCF23Q7RTU1 214 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 APH1BQ8WW43 257 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CYGBQ8WWM9 190 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 S100A13Q99584 98 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 ZNF649Q9BS31 505 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 TCF19Q9Y242 345 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-222ENST00000540445 IRGMA1A4Y4 181 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MEGF11A6BM72 1044 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 FAM172BPA6NC97 362 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 H0YJX3 145 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HSPB6O14558 160 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HTR3BO95264 441 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TSPAN15O95858 294 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LIMS3P0CW19 117 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LIMS4P0CW20 117 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MYL12AP19105 171 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CDK2P24941 298 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 DCKP27707 260 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MTNR1BP49286 362 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ETV1P50549 477 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 EFNB2P52799 333 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PRRX1P54821 245 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 IL18R1Q13478 541 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MED21Q13503 144 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CCDC58Q4VC31 144 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TTC23Q5W5X9 447 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 Q6P435 159 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CHST4Q8NCG5 386 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZNF596Q8TC21 504 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GPR148Q8TDV2 347 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CORO2AQ92828 525 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 RDH12Q96NR8 316 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ING4Q9UNL4 249 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ODAMA1E959 279 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 A6NDX4 124 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 LEUTXA8MZ59 168 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CD24P25063 80 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 NFYBP25208 207 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 BRS3P32247 399 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CEACAM3P40198 252 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PTGFRP43088 359 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ARHGDIBP52566 201 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZP1P60852 638 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PPP3R1P63098 170 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CDK5R1Q15078 307 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 SETD9Q8NE22 299 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 PXT1Q8NFP0 134 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TMEM106AQ96A25 262 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 TMEM80Q96HE8 168 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR5M11Q96RB7 305 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 JAM3Q9BX67 310 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 DPM3Q9P2X0 92 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LMO3-222ENST00000540445 GABRPO00591 440 aa7.25□□□□□ -1.25
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