RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678		Q8N2B8	174 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678		A6NDX4	124 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OGG1	O15527	345 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CALCB	P10092	127 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CD34	P28906	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	PAX5	Q02548	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR52N1	Q8NH53	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	MAGEB3	O15480	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF44	P15621	663 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678		A0A087X0M5	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678		A0A1B0GX30	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ODAM	A1E959	279 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	GABRP	O00591	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	DEGS1	O15121	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CLIC3	O95833	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	MYL12A	P19105	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	GLIPR1	P48060	266 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	RAB13	P51153	203 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	BDH1	Q02338	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	AES	Q08117	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	MED21	Q13503	144 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	RCN1	Q15293	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SSX2	Q16385	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	COQ2	Q96H96	371 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MATR3-222	ENST00000513678	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	GPX5	O75715	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	MMP23A	O75900	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	OPN1MW	P04001	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	CDK2	P24941	298 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	HTR1D	P28221	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	SOX2	P48431	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	KCNJ3	P48549	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25

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