RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L2P0CJ85 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L3P0CJ86 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L4P0CJ87 422 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L5P0CJ88 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L6P0CJ89 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L7P0CJ90 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ARSBP15848 533 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB3BP20337 219 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUSP1P28562 367 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RX3P56373 397 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVFRD-1P60508 538 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 INSL4Q14641 139 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB11BQ15907 218 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6P435 159 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf107Q6ZR85 190 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 LYPD6Q86Y78 171 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD7Q96MP8 289 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SIRPDQ9H106 197 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R3Q9NYW6 316 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX4Q9UBX2 424 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM82A0PJX8 343 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PSPNO60542 156 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 FSHBP01225 129 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SELLP14151 372 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 MGMTP16455 207 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CD36P16671 472 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PRTN3P24158 256 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PAX5Q02548 391 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 C22orf42Q6IC83 251 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52W1Q6IF63 320 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 USP43Q70EL4 1123 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TCF21O43680 179 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 AVPP01185 164 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF728P0DKX0 622 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CALCBP10092 127 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP9P14780 707 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR3A1P47881 315 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 EDDM3AQ14507 147 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGYQ3MUY2 71 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF144BQ7Z419 303 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CORO2AQ92828 525 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF714Q96N38 554 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OCEL1Q9H607 264 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 FCN3O75636 299 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 TFF1P04155 84 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 GZMHP20718 246 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 FUT3P21217 361 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CFPP27918 469 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2E1P51965 193 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 NEK7Q8TDX7 302 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST6Q9GZX3 395 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 PPA2Q9H2U2 334 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms