RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394		Q6ZPA2	131 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	RDH5	Q92781	318 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PLA2G10	O15496	165 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PSPN	O60542	156 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	NAPSA	O96009	420 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	TFF1	P04155	84 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF44	P15621	663 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PRDX2	P32119	198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	GDNF	P39905	211 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	GNG2	P59768	71 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PAX5	Q02548	391 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	CCL17	Q92583	94 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	DYRK2	Q92630	601 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	GLS2	Q9UI32	602 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-231	ENST00000502394	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ISPD	A4D126	451 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	SIRPB1	O00241	398 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	NDUFS7	O75251	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	LY6H	O94772	140 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF205	O95201	554 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	PAX1	P15863	534 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	DTYMK	P23919	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	CBX5	P45973	191 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	OR3A1	P47881	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	KCNJ3	P48549	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	EFNA4	P52798	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	COL10A1	Q03692	680 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	MICB	Q29980	383 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	HFE	Q30201	348 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	SIGLEC5	O15389	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	RBBP9	O75884	186 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	CSN2	P05814	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	FCGR3A	P08637	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	DAO	P14920	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	SSTR2	P30874	369 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	RCVRN	P35243	200 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ACTB	P60709	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ACTG1	P63261	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	SCN1B	Q07699	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ASAH1	Q13510	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-231	ENST00000502394	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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