RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TBX15	Q96SF7	602 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GCG	P01275	180 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PGA4	P0DJD7	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PGA5	P0DJD9	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	EFNB1	P98172	346 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TNFSF11	O14788	317 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GREM1	O60565	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PITX3	O75364	302 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	HRAS	P01112	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF774	Q6NX45	483 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TAAR6	Q96RI8	345 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PPC4	97 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	DANCR	P0C864	163 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CT45A6	P0DMU7	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CT45A5	P0DMU8	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CT45A7	P0DMV0	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MMP9	P14780	707 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	BMP5	P22003	454 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CYB561	P49447	251 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS12	P56730	875 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR8G1	Q15617	311 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GAPT	Q8N292	157 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-C	Q95604	372 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GALM	Q96C23	342 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TRDC	B7Z8K6	153 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	C4orf51	C9J302	202 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MYOG	P15173	224 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GAMT	Q14353	236 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SARG	Q9BW04	601 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CEP290	O15078	2479 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SLC31A2	O15432	143 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF32	P17041	273 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	PRR27	Q6MZM9	219 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	FAM166B	A8MTA8	275 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574		J3QR89	54 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SOX15	O60248	233 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TNFSF4	P23510	183 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GAS1	P54826	345 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	DYRK2	Q92630	601 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC61	Q9BV99	259 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	LIPT2	A6NK58	231 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	IGHE	P01854	428 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ARR3	P36575	388 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	FHIT	P49789	147 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	RND3	P61587	244 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF253	O75346	499 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TRGC1	P0CF51	173 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	OR1P1	Q8NH06	330 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	C10orf35	Q96D05	121 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	REG4	Q9BYZ8	158 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJC13	O75165	2243 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ISG15	P05161	165 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	IL9	P15248	144 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	DDA1	Q9BW61	102 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PKD1-222	ENST00000496574	C12orf49	Q9H741	205 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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