RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB11O95342 1321 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SOD3P08294 240 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TWIST2Q8WVJ9 160 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 MED10Q9BTT4 135 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 POMKQ9H5K3 350 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 GAPVD1Q14C86 1478 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF233A6NK53 670 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 IGLL5B9A064 214 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP8O95379 198 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 PTHLHP12272 177 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 M6PRP20645 277 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TSPOP30536 169 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA6P43360 314 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 AQP5P55064 265 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 FAM53BQ14153 422 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF738Q8NE65 137 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 OR1P1Q8NH06 330 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 VWA8A3KMH1 1905 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 COL1A2P08123 1366 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GX12 115 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SULT1C2O00338 296 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV5-2P06315 115 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 RAB25P57735 213 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB6Q15916 424 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM215Q68D42 235 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC45Q96CN5 670 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 H3BP45 60 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD6O75340 191 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 FSTL3O95633 263 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1-17P01599 117 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B10P36537 528 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 CBX5P45973 191 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF83P51522 516 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 OLFM3Q96PB7 478 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 HBEGFQ99075 208 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0232Q92628 1395 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-212ENST00000491302 K7ERS5 55 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 M0QXV9 152 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SYT1P21579 422 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RAB31Q13636 194 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBP7Q16270 282 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 NXNL2Q5VZ03 156 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 AMN1Q8IY45 258 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR8S1Q8NH09 359 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ACTL9Q8TC94 416 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 MRAP2Q96G30 205 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 VSIRQ9H7M9 311 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 NCAPD3P42695 1498 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LEUTXA8MZ59 168 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 DMTNQ08495 405 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 OR2M3Q8NG83 312 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01587Q99440 93 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.13□□□□□ -1.75
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