RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OTOS	Q8NHW6	89 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	AQP3	Q92482	292 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GON7	Q9BXV9	100 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	REEP1	Q9H902	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CMC2	Q9NRP2	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NDE1	Q9NXR1	346 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.77	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ODF3B	A8MYP8	253 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388		K7N7A8	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DLGAP1	O14490	977 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF254	O75437	659 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DHRS3	O75911	302 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR2F2	O95006	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SERPINA3	P01011	423 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TFF1	P04155	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HMGN1	P05114	100 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OCM2	P0CE71	109 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CLU	P10909	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GABRR1	P24046	479 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PRRX1	P54821	245 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	EDDM3A	Q14507	147 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF273	Q14593	569 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MICA	Q29983	383 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ASRGL1	Q7L266	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388		Q8IYB0	196 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CEP19	Q96LK0	163 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CDRT15	Q96T59	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GHITM	Q9H3K2	345 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZFP57	Q9NU63	452 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		3.76	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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