RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	NDNF	Q8TB73	568 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MND1	Q9BWT6	205 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SLITRK2	Q9H156	845 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	METTL9	Q9H1A3	318 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	C1RL	Q9NZP8	487 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JK05	382 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CLPX	O76031	633 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MAS1	P04201	325 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CDK1	P06493	297 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PTGFR	P43088	359 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	GLIPR1	P48060	266 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	DLX6	P56179	175 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MED22	Q15528	200 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	FAM189A2	Q15884	450 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PIGY	Q3MUY2	71 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR5R1	Q8NH85	324 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TGFBR2	P37173	567 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	GLP1R	P43220	463 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		Q6P435	159 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TCF23	Q7RTU1	214 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF747	Q9BV97	191 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TMED9	Q9BVK6	235 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ODAM	A1E959	279 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	POM121C	A8CG34	1229 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RBP4	P02753	201 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ALDOB	P05062	364 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	HSMCR30	P0CW71	290 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CDK2	P24941	298 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	NFYB	P25208	207 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RELB	Q01201	579 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SSX2	Q16385	188 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LTC4S	Q16873	150 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OSR2	Q8N2R0	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SGCD	Q92629	289 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MUL1	Q969V5	352 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RNF114	Q9Y508	228 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GUS0	222 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LMO1	P25800	156 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	AWAT2	Q6E213	333 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	COQ2	Q96H96	371 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR5M11	Q96RB7	305 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	KIF25	Q9UIL4	384 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.6 ms