RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CCDC66-211	ENST00000468108	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CCDC66-211	ENST00000468108	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CCDC66-211	ENST00000468108	LAMA5	O15230	3695 aa		4.4	□□□□□ -1.7
CCDC66-211	ENST00000468108	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		A8MXE2	369 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		H3BSH0	61 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		H7C417	338 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	LMX1B	O60663	402 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RAD51D	O75771	328 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RBBP9	O75884	186 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	LYZL6	O75951	148 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SCGN	O76038	276 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RPA2	P15927	270 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CXCL3	P19876	107 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	HTR2C	P28335	458 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	S100A11	P31949	105 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CCR6	P51684	374 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CASP6	P55212	293 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ACTB	P60709	375 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ACTG1	P63261	375 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM3A	P98173	230 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PMPCA	Q10713	525 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	HES5	Q5TA89	166 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MDP1	Q86V88	176 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PTX4	Q96A99	478 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ACACA	Q13085	2346 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		A0A0D9SG52	128 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		A6NIN4	97 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108		G3V3Q6	166 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	GMDS	O60547	372 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MPC2	O95563	127 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CST4	P01036	141 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MT-ND4	P03905	459 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	HCK	P08631	526 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	UBB	P0CG47	229 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CTRB1	P17538	263 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	CCNO	P22674	350 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	PRKACB	P22694	351 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	MT3	P25713	68 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RAD52	P43351	418 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	VEGFC	P49767	419 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	FUT6	P51993	359 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	TAS2R20	P59543	309 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZP1	P60852	638 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF92	Q03936	586 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CCDC66-211	ENST00000468108	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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