RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 COLCA2A8K830 154 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR171O14626 319 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP8B1O43520 1251 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2A4O95047 310 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IL4P05112 153 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CECR9P0C854 216 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC2A1P11166 492 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PSKH1P11801 424 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-DMAP28067 261 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL23P55773 120 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CLDN12P56749 244 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 TAS2R43P59537 309 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 C1QTNF8P60827 252 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC20Q12834 499 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SSX1Q16384 188 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE3AQ5TA76 89 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GALNT10Q86SR1 603 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 MBOAT7Q96N66 472 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2A7Q96R45 310 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY9O60503 1353 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM183AA6NL82 134 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 C8orf87E5RJ46 101 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 I3L4J1 428 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SCO1O75880 301 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 MAS1P04201 325 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMD7P51665 324 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP10-8P60410 259 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 DMC1Q14565 340 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IGFL1Q6UW32 110 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 C8orf76Q96K31 380 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A8Q9BY19 250 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 COMMD9Q9P000 198 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NOS1P29475 1434 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 A8MWL6 223 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 F5H5K5 113 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BP45 60 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PHYHO14832 338 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC37A4O43826 429 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ENTPD6O75354 484 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM3AP98173 230 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ELOCQ15369 112 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 LY6EQ16553 131 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SP6Q3SY56 376 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00596Q86U02 117 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PDPNQ86YL7 162 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ITPRIPQ8IWB1 547 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD5Q96DB9 178 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 DERL3Q96Q80 235 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 OR51E2Q9H255 320 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.15□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIP11Q15643 1979 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K5Q99683 1374 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 LGALS9O00182 355 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 HPGDSO60760 199 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 EPPINO95925 133 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC11BP0C7V7 166 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 COX5BP10606 129 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SPNP16150 400 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 IMPA1P29218 277 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGEA2P43356 314 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF235Q14590 738 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC26Q2I0M4 334 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC36A2Q495M3 483 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.14□□□□□ -1.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC15Q8N387 334 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms