RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 SLC10A1Q14973 349 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN9-201ENST00000445369 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN9-201ENST00000445369 MKXQ8IYA7 352 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN9-201ENST00000445369 TP53RKQ96S44 253 aa15.28■□□□□ 0.04
CLDN9-201ENST00000445369 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 IL18BPO95998 194 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 DUSP1P28562 367 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 WNT5AP41221 380 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ARID1AO14497 2285 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 KNTC1P50748 2209 aa15.27■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 CDK2AP1O14519 115 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SYNGR1O43759 233 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 CD46P15529 392 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 KCNJ3P48549 501 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 OR52M1Q8NGK5 317 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ERGIC1Q969X5 290 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 C12orf49Q9H741 205 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FAM74A7A6NL05 159 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 MPPED1O15442 326 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 DIRAS3O95661 229 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 GNRHRP30968 328 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 APLNRP35414 380 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 LPAR6P43657 344 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TGIF1Q15583 401 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SLC35G3Q8N808 338 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ZFP57Q9NU63 452 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 GPR31O00270 319 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 LILRA1O75019 489 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 MED6O75586 246 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SCTP09683 121 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 CLN3Q13286 438 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HERPUD1Q15011 391 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SVBPQ8N300 66 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ARV1Q9H2C2 271 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HRH4Q9H3N8 390 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 NCOR1O75376 2440 aa15.25■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TK1P04183 234 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 RND3P61587 244 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 IL13RA2Q14627 380 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ESPL1Q14674 2120 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TSC22D1Q15714 1073 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 GUCA2BQ16661 112 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 LINC00596Q86U02 117 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 DOCK7Q96N67 2140 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 OR5B21A6NL26 309 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 GPR137BO60478 399 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 FBXO24O75426 580 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TUSC2O75896 110 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF806P0C7X5 589 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PRKACAP17612 351 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 P2RY1P47900 373 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 CAV2P51636 162 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 SRPXP78539 464 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PLK3Q9H4B4 646 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 RHOFQ9HBH0 211 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 PARP11Q9NR21 331 aa15.24■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ARGFXA6NJG6 315 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 HSPB6O14558 160 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 ST8SIA3O43173 380 aa15.23■□□□□ 0.03
CLDN9-201ENST00000445369 KIR2DS4P43632 304 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms