RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 HTR6P50406 440 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LILRA4P59901 499 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TNXAQ16473 311 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 UCN2Q96RP3 112 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FAM231BA6NCW3 169 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ANTXRLA6NF34 631 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TOMM40O96008 361 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 SYT8Q8NBV8 401 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF563Q8TA94 476 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SUSD6Q92537 303 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 OLIG2Q13516 323 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 INSL6Q9Y581 213 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 WDR81Q562E7 1941 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 hADV38S2A0JD32 116 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CXorf1O96002 111 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 COX5AP20674 150 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JNG1 304 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 MMP23AO75900 390 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 IGLC3P0DOY3 106 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS5Q14953 304 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CD38P28907 300 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RING1Q06587 406 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 AQP10Q96PS8 301 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.93□□□□□ -1.62
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