RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 KRT74Q7RTS7 529 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CALHM1Q8IU99 346 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 POC1AQ8NBT0 407 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NDNFQ8TB73 568 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PP6455Q8WZ26 134 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 THRSPQ92748 146 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TMEM106AQ96A25 262 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SLAMF9Q96A28 289 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RFT1Q96AA3 541 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 KCTD7Q96MP8 289 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 GAFA1Q96PS6 74 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NEK6Q9HC98 313 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PQ09 198 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SMIM30A4D0T7 59 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A1O15245 554 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ARL6IP5O75915 188 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 UCHL1P09936 223 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PGA5P0DJD9 388 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PSG2P11465 335 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ATF1P18846 271 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FUT6P51993 359 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ATP1B3P54709 279 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MTCP1P56278 107 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MXD1Q05195 221 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DGUOKQ16854 277 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZSR3 168 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 C10orf35Q96D05 121 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MED30Q96HR3 178 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SHISA3A0PJX4 238 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 G3V4G9 280 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SIGLEC5O15389 551 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FCN3O75636 299 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CDRT1O95170 752 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CYB5AP00167 134 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 HCKP08631 526 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CALCBP10092 127 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 AMY2BP19961 511 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PRKACBP22694 351 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SDC2P34741 201 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RBP2P50120 134 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 LOXL3P58215 753 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 IL24Q13007 206 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MRAPQ8TCY5 172 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PHYHIPQ92561 330 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CEP19Q96LK0 163 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SPACA5Q96QH8 159 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PKIBQ9C010 78 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RASL12Q9NYN1 266 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CKLFQ9UBR5 152 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NPFFO15130 113 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MAS1P04201 325 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FSTP19883 344 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MPZP25189 248 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MTNR1BP49286 362 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PPP3R1P63098 170 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZPA2 131 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms