RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 RASD1Q9Y272 281 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ALG5Q9Y673 324 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 CACNG2Q9Y698 323 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 COL7A1Q02388 2944 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0A6YYH2 397 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 A6NJ64 397 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 LRRN3E7EW58 273 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 J3QLW9 94 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 AIPO00170 330 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-211ENST00000429595 TCRBP04435 133 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 GKN3PP0CG01 181 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TFPIP10646 304 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PSKH1P11801 424 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF19P17023 458 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SPI1P17947 270 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 C4BPBP20851 252 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ARR3P36575 388 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-211ENST00000429595 GDI2P50395 445 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR12D2P58182 307 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 HOXC5Q00444 222 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 GALK2Q01415 458 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PAX8Q06710 450 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF74Q16587 644 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ESCO2Q56NI9 601 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR6V1Q8N148 313 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SPICQ8N5J4 248 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T4Q8NH00 348 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 GPR148Q8TDV2 347 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PTX4Q96A99 478 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 UPRTQ96BW1 309 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf36Q96KX1 117 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRK-211ENST00000429595 ABHD1Q96SE0 405 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ASCL2Q99929 193 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 MMP28Q9H239 520 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 NLKQ9UBE8 527 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C68A6NDL8 312 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 FAM183AA6NL82 134 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 IFITM5A6NNB3 132 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf100A8MU93 164 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 E9PI62 339 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF264O43296 627 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ANGPTL7O43827 346 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 EFNA2O43921 213 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 UPK3AO75631 287 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN9O75954 239 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 CBR1P16152 277 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 ALOX5APP20292 161 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 M6PRP20645 277 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 STOMP27105 288 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 DCTDP32321 178 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-211ENST00000429595 PYCR1P32322 319 aa5.05□□□□□ -1.6
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