RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAL2Q969L2 176 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRORYQ9H606 182 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAB20Q9NX57 234 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DOK5Q9P104 306 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OTOFQ9HC10 1997 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RGS12O14924 1447 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PXDNLA1KZ92 1463 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A0G2JQZ4 141 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CENPXA8MT69 81 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 M0R1B8 84 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC25A20O43772 301 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TAC1P20366 129 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PMCHP20382 165 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GABRR2P28476 465 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 S100A2P29034 98 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BNIP2Q12982 314 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR176Q14439 515 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMDQ15546 238 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLCXD3Q63HM9 321 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GLYATQ6IB77 296 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TPGS1Q6ZTW0 290 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CMTM8Q8IZV2 173 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC148Q8NFR7 591 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NAT6Q93015 286 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADTRPQ96IZ2 230 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RETNLBQ9BQ08 111 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C20orf144Q9BQM9 153 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ULBP1Q9BZM6 244 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BCL2L14Q9BZR8 327 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC38A1Q9H2H9 487 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNIP2Q9NS61 270 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NDUFB11Q9NX14 153 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLIT2O94813 1529 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOS1P29475 1434 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COL4A2P08572 1712 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SBNO1A3KN83 1393 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1W2PRF3 423 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1W2PRM7 423 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTAGE15A4D2H0 777 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WRBO00258 174 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNX4O95219 450 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CD36P16671 472 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAGEA12P43365 314 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TAS2R60P59551 318 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM201AQ5SY85 155 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM27D1Q5T7N8 215 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2W3Q7Z3T1 314 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTAGE6Q86UF2 777 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NELFCDQ8IXH7 590 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OFCC1Q8IZS5 231 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIH1D2Q8WWB5 315 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMBIM1Q969X1 311 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CAPZA3Q96KX2 299 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BPIFA3Q9BQP9 254 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPZ1Q9BXG8 430 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYSTM1Q9H1C7 97 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EXO5Q9H790 373 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C12orf4Q9NQ89 552 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDIT4Q9NX09 232 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANXA10Q9UJ72 324 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LINC00588Q9Y4M8 146 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SHANK3Q9BYB0 1731 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NRCAMQ92823 1304 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FBN2P35556 2912 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC169A6NNP5 214 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A8MWP6 167 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SOX14O95416 240 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RWDD2BP57060 319 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC35B1P78383 322 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IRF8Q02556 426 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF117Q03924 483 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C2orf80Q0P641 193 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IL18Q14116 193 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NXNL2Q5VZ03 156 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EPGNQ6UW88 154 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC121Q6ZUS5 278 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COMMD1Q8N668 190 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NDNFQ8TB73 568 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GTF2H4Q92759 462 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OLFM3Q96PB7 478 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms