RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 Q8IYB0 196 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T29Q8NH02 315 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 BORCS8Q96FH0 119 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIRREL1Q96J84 757 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GON7Q9BXV9 100 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ABCG5Q9H222 651 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC182A6NF36 153 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GP9P14770 177 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CCL1P22362 96 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 VEGFCP49767 419 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CFHR3Q02985 330 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ODF4Q2M2E3 257 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 COQ2Q96H96 371 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D1BO14796 132 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 JTBO76095 146 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HMGN1P05114 100 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1B2P21281 511 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CDK5Q00535 292 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 EBI3Q14213 229 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF429Q86V71 674 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR8H3Q8N146 312 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 Q8N9W7 124 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HMG20AQ9NP66 347 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LDLRAD4O15165 306 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IGHG4P01861 327 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CGB3P0DN86 165 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CGB7P0DN87 165 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRDX6P30041 224 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 POU3F4P49335 361 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 RAB7AP51149 207 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MADCAM1Q13477 382 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GIPC3Q8TF64 312 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DCUN1D4Q92564 292 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GNB4Q9HAV0 340 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PSG11Q9UQ72 335 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SASH3O75995 380 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR8U8P0C7N1 319 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PSMB8P28062 276 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 GNG10P50151 68 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CXCR4P61073 352 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SCN1BQ07699 218 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HDXQ7Z353 690 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CHST5Q9GZS9 411 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 I3L521 148 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SAP30O75446 220 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CYB5AP00167 134 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 RBP2P50120 134 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ATP1B3P54709 279 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF616Q08AN1 781 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LTC4SQ16873 150 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MOB3BQ86TA1 216 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 Q8N6K4 173 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OVOL1O14753 267 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SYT7O43581 403 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV1D-12P01611 117 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CSN2P05814 226 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF44P15621 663 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 VDAC1P21796 283 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GNB1P62873 340 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 Q6P435 159 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD7Q96MP8 289 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms