RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395727.6

PTPN20-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN20, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-208	ENST00000395727	PRKACB	P22694	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LMO1	P25800	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	EFNB2	P52799	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CAPZA1	P52907	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ATP1B3	P54709	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GMFB	P60983	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PAX5	Q02548	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RAB40B	Q12829	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GALE	Q14376	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SNX22	Q96L94	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q96MT0	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TBX5	Q99593	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MMP27	Q9H306	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		F8VVB4	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		F8VWA3	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MGST3	O14880	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KDM4B	O94953	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HTR1A	P08908	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CCL3L1	P16619	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ATF1	P18846	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PEX2	P28328	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CD34	P28906	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR12D2	P58182	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	COL10A1	Q03692	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF273	Q14593	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q8N2B8	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PNKD	Q8N490	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q8NFD4	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SSX3	Q99909	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A087X0M5	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A1B0GX30	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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