RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL18A1P39060 1754 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2AT4A6NND4 320 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A20O43772 301 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOD3P08294 240 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCGB1C2P0DMR2 95 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 XKP51811 444 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAD51Q06609 339 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 IDI1Q13907 227 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q499Y3 187 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPANXN2Q5MJ10 180 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAIR2Q6ISS4 152 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MARCH3Q86UD3 253 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM184AQ8NB25 1140 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERMNQ8TAM6 284 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 NT5CQ8TCD5 201 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCGB1C1Q8TD33 95 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADTRPQ96IZ2 230 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLT1D1Q96MS3 346 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RILPQ96NA2 401 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLIN2Q99541 437 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ULBP1Q9BZM6 244 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 BCL2L14Q9BZR8 327 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 XKR8Q9H6D3 395 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNIP2Q9NS61 270 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC5A10A0PJK1 596 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 UPK2O00526 184 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPLX1O14810 134 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CECR9P0C854 216 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALOX5APP20292 161 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCR7P32248 378 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP6V0D1P61421 351 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJC3Q13217 504 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MMDQ15546 238 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZBTB6Q15916 424 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPRG1LQ5T0D9 272 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 IDNKQ5T6J7 187 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM53Q6P2H8 277 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERICH5Q6P6B1 374 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPGS1Q6ZTW0 290 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GALNT10Q86SR1 603 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 LUZP2Q86TE4 346 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZIC4Q8N9L1 334 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR11G2Q8NGC1 345 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR4X2Q8NGF9 303 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNRF2Q8NHG8 242 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMIGD2Q96BF3 282 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2M4Q96R27 311 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 C20orf144Q9BQM9 153 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANAPC13Q9BS18 74 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOVL6Q9H5J4 265 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 C6orf50Q9HD87 102 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SDHAF3Q9NRP4 125 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFB11Q9NX14 153 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBC1D24Q9ULP9 559 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMCC3Q9ULS5 477 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1B0GVG6 124 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGSF23A1L1A6 192 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 A8MWP6 167 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TEX46H3BTG2 121 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCAPO15273 167 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD36P16671 472 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAC1P20366 129 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR4P46093 362 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 HCCSP53701 268 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 MLF1P58340 268 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 APOFQ13790 326 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR176Q14439 515 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 GID4Q8IVV7 300 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPACA4Q8TDM5 124 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCP10LQ8TDR4 215 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 C22orf15Q8WYQ4 148 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPB2Q96IY4 423 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms