RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PDPNQ86YL7 162 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 FCN1O00602 326 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 ZNHIT1O43257 154 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 PIGYQ3MUY2 71 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 IL13RA2Q14627 380 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 MMP24Q9Y5R2 645 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 CRXO43186 299 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 GNG7O60262 68 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM97Q5BJF2 176 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa19.68■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF441Q8N8Z8 693 aa19.66■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 ANXA10Q9UJ72 324 aa19.65■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 UQCC3Q6UW78 93 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRM-201ENST00000332175 ADTRPQ96IZ2 230 aa19.65■□□□□ 0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4P4Q8NGL7 312 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RPL7P18124 248 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SPCS3P61009 180 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf17Q8NAS9 161 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 DNPH1O43598 174 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 NAAAQ02083 359 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 PSG5Q15238 335 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC18BQ6UXF7 455 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 VSTM2AQ8TAG5 236 aa19.64■□□□□ 0.73
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