RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 V9GYH0 126 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 A0A0A6YYD4 124 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 FAM25AB3EWG3 89 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 FAM25CB3EWG5 89 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 FAM25GB3EWG6 89 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PFDN1O60925 122 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RP2O75695 350 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 MELTFP08582 738 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CD40LGP29965 261 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PRRX1P54821 245 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFA5Q16718 116 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 MFSD4AQ8N468 514 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CHST4Q8NCG5 386 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 OR10K1Q8NGX5 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PHF21AQ96BD5 680 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF488Q96MN9 340 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 BANF2Q9H503 90 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TREM1Q9NP99 234 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 NUDT15Q9NV35 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 FABP12A6NFH5 140 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 OOEPA6NGQ2 149 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CLDN25C9JDP6 229 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PPIAL4DF5H284 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 LGALS8O00214 317 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 SULT1C2O00338 296 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 SH2D1BO14796 132 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFA2O43678 99 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PDCD6O75340 191 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 HLA-DQB1P01920 261 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 EGR1P18146 543 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CDK2P24941 298 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 COL8A1P27658 744 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CHATP28329 748 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ3P48549 501 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PTH2RP49190 550 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 VEGFCP49767 419 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM50BP56557 158 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM33P57088 247 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PAX5Q02548 391 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF846Q147U1 533 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ8Q15842 424 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 Q6P435 159 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CHODLQ9H9P2 273 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TREM2Q9NZC2 230 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 NLKQ9UBE8 527 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF222Q9UK12 451 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 SERPINE3A8MV23 424 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 MFNGO00587 321 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 SSX5O60225 188 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 STAG3L3P0CL85 134 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 DAOP14920 347 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 FUT3P21217 361 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 COL8A2P25067 703 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 CDKN1AP38936 164 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TAS2R20P59543 309 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 MICBQ29980 383 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 PIGYQ3MUY2 71 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM69Q5SWH9 247 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 STUMQ69YW2 141 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 Q6ZTK2 550 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ST8SIA4Q92187 359 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 YIPF5Q969M3 257 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RAB3CQ96E17 227 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 SDSLQ96GA7 329 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 NICN1Q9BSH3 213 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 GSX2Q9BZM3 304 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 AUNIPQ9H7T9 357 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-202ENST00000317118 RNF24Q9Y225 148 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms