RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268057.8

BBS4-201, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBS4, Length 2,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4-201ENST00000268057 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 F5H5K5 113 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 F10P00742 488 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 CTXN2P0C2S0 81 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 LIFP15018 202 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 TCN2P20062 427 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 ZFP82Q8N141 532 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 IP6K3Q96PC2 410 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 UCN2Q96RP3 112 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 OR5H15A6NDH6 313 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 A6NLC8 198 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 MPPED1O15442 326 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 XRCC2O43543 280 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 NME2P1O60361 137 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 FUT3P21217 361 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 HERV-K104P61576 105 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 NANPQ8TBE9 248 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 M1APQ8TC57 530 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 FBXO17Q96EF6 278 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.3□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.3□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 M0R036 132 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 YKT6O15498 198 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 TUSC2O75896 110 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 PPYP01298 95 aa7.29□□□□□ -1.24
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BBS4-201ENST00000268057 NMSQ5H8A3 153 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 LINC00596Q86U02 117 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 TRIOO75962 3097 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.29□□□□□ -1.24
BBS4-201ENST00000268057 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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