RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 DERL3Q96Q80 235 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 STARD10Q9Y365 291 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 CD200P41217 278 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA0040Q15053 153 aa11.88□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 GPX5O75715 221 aa11.88□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 HAGHQ16775 308 aa11.87□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF122Q9H9V4 155 aa11.87□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 SH2D2AQ9NP31 389 aa11.87□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM123Q8N131 208 aa11.87□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 FOXL2P58012 376 aa11.86□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 HLA-DRB3P79483 266 aa11.86□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.86□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZG16BQ96DA0 208 aa11.86□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 PDPNQ86YL7 162 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM219AQ8IW50 185 aa11.85□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.85□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 MC5RP33032 325 aa11.85□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.85□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 CXorf58Q96LI9 332 aa11.85□□□□□ -0.51
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PDGFRB-201ENST00000261799 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 NAA60Q9H7X0 242 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 RASL12Q9NYN1 266 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 MGST3O14880 152 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 RAB29O14966 203 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 SCO1O75880 301 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 OXA1LQ15070 435 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 TOR2AQ5JU69 321 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PDGFRB-201ENST00000261799 STARD4Q96DR4 205 aa11.85□□□□□ -0.51
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