RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MUCL1Q96DR8 90 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TMEM68Q96MH6 324 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 NELFAQ9H3P2 528 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CD300LBA8K4G0 201 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PRR32B1ATL7 298 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 NKX2-8O15522 239 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CDC14BO60729 498 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 WISP1O95388 367 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BGLAPP02818 100 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ADRA2CP18825 462 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SOX8P57073 446 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SKA3Q8IX90 412 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CYYR1Q96J86 154 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MMP26Q9NRE1 261 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SLC22A20A6NK97 555 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 AGFG2O95081 481 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PMS2P2O95744 297 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IFNA10P01566 189 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CELA3AP09093 270 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IAPPP10997 89 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PIGPP57054 158 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TESK1Q15569 626 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IGFBP7Q16270 282 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 UQCC3Q6UW78 93 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF709Q8N972 641 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MRI1Q9BV20 369 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RFNGQ9Y644 331 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 M0R296 226 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CLDN1O95832 211 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IFNA5P01569 189 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MEOX1P50221 254 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SLC25A1P53007 311 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PIGYQ3MUY2 71 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CDC20BQ86Y33 519 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GCM1Q9NP62 436 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.67□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 M0R1B8 84 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 VAMP5O95183 116 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF83P51522 516 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IL11RAQ14626 422 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR8B8Q15620 311 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SAP25Q8TEE9 199 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ASB10Q8WXI3 467 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 A0A0G2JMM0 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 A0A1W2PPB8 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 A0A1W2PRS3 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 LNP1A1A4G5 178 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 EREGO14944 169 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DEGS1O15121 323 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ONECUT2O95948 504 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HEXAP06865 529 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CALCRP30988 508 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TAS2R46P59540 309 aa6.66□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 EFNB1P98172 346 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms