RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173740.1

Lgr5-208, Transcript of Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Lgr5, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Negr1	Q80Z24	348 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lmf2	Q8C3X8	702 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Znf385a	Q8VD12	386 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr803	Q8VFI3	308 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1377	Q8VGH1	307 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr642	Q924X8	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Arl4d	Q99PE9	201 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cela3b	Q9CQ52	269 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ndufa6	Q9CQZ5	131 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		Q9CRW3	126 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Uqcc1	Q9CWU6	295 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aurkaip1	Q9DCJ7	200 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nox4	Q9JHI8	578 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Scly	Q9JLI6	432 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pole	Q9WVF7	2283 aa		10.15	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm28961	A0A087WPA5	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm21117	A0A087WPJ9	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm20820	A0A087WPP3	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm20937	A0A087WQA3	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm21258	A0A087WQC7	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm21095	A0A087WR14	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm20824	A0A087WS97	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm29866	A0A0A6YX04	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc25a53	A2AF28	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm438	B1ASB3	393 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Npffr1	E9Q468	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr610	E9Q598	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm19684	G3UZ45	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr597	L7N224	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gdf1	P20863	357 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppib	P24369	216 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Doc2b	P70169	412 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Clu	Q06890	448 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tmem231	Q3U284	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mtcp1	Q60945	107 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1225	Q7TR01	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		Q80VP5	184 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fam180a	Q8BR21	173 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ubqln3	Q8C5U9	658 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cdnf	Q8CC36	187 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nsun5	Q8K4F6	465 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lsm10	Q8QZX5	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1489	Q8VFQ5	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr272	Q8VGA0	319 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tspan2	Q922J6	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tex29	Q9DA77	186 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fcrls	Q9EQY5	509 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tlnrd1	Q9ERE8	362 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Actl6a	Q9Z2N8	429 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trav8n-2	A0A075B633	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rpl7a-ps5	A0A140T8L3	268 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1150-ps1	A0A1L1STL1	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Amy2a1	E9PV85	245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn2r83	E9Q0G7	864 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rarres1	F6ZIS7	283 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm20939	L7N243	523 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fcn1	O70165	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Itln1	O88310	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pvalb	P32848	110 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rap1a	P62835	184 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr733	Q14AK5	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pilra	Q2YFS3	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Xkrx	Q5GH68	449 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Epha1	Q60750	977 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr11	Q60890	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sntb2	Q61235	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr851	Q7TRG0	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr657	Q7TRP7	319 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc30a8	Q8BGG0	367 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tbl1xr1	Q8BHJ5	514 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rap1b	Q99JI6	184 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pnrc2	Q9CR73	140 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sec11c	Q9D8V7	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		Q9D9C7	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Keg1	Q9DCY0	295 aa		10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cenpe	Q6RT24	2474 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trav15d-2-dv6d-2	A0A0G2JGQ7	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm4131	A0A140LJ24	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1124	A2AT86	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp944	E9PUS4	492 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trav13d-3	J3QMG8	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cd46	O88174	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ache	P21836	614 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gnrhr	Q01776	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lingo2	Q3URE9	606 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lin54	Q571G4	749 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	B630019K06Rik	Q7TNS5	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1321	Q7TQW4	319 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lax1	Q8BHB3	407 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sirt7	Q8BKJ9	402 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gper1	Q8BMP4	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm17324	Q8C6J8	137 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cd300e	Q8K249	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Foxn4	Q8K3Q3	521 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	B4galt7	Q8R087	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Flvcr2	Q91X85	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppif	Q99KR7	206 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Alg5	Q9DB25	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm21858	A0A087WQ24	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	2610044O15Rik8	A0A087WRJ1	410 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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