RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmprss11gQ8BZ10 417 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cacul1Q8R0X2 377 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnrc2Q9CR73 140 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shisa5Q9D7I0 235 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sun5Q9DA32 373 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nubp2Q9R061 275 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cxcl15Q9WVL7 167 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm15130F6PYN5 206 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr199F6ZUS0 308 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygsO35486 178 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Amy2P00688 508 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P06321 130 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PlatP11214 559 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NodalP43021 354 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf122Q8BP31 155 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5662Q8BX20 144 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pomt1Q8R2R1 746 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr51Q8VGG9 307 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nudcd2Q9CQ48 157 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asf1bQ9DAP7 202 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MvkQ9R008 395 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec4dQ9Z2H6 219 aa18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm20489A2AGH5 449 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr33O88416 339 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P04945 108 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fgf4P11403 202 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Drd3P30728 446 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnase2P56542 353 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lyg2Q3V1I0 213 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BC061237Q6P8I2 184 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsl1Q7M6Y1 485 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 F830045P16RikQ8BJ95 487 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr168Q8VF05 312 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufb11O09111 151 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hist1h1cP15864 212 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galr1P56479 348 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc38a11Q3USY0 453 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clpsl2Q3UW21 102 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxw22Q5XG67 466 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfsd8Q8BH31 519 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem234Q8R1E7 140 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr401Q8VFX6 315 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhf2Q91WB4 249 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem205Q91XE8 189 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BmfQ91ZE9 185 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PipoxQ9D826 390 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TinagQ9WUR0 475 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FggyA2AJL3 552 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5901D3YVJ1 333 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr225E9PWF9 419 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4778L7N229 365 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 S1pr1O08530 382 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lmx1bO88609 395 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mbl2P41317 244 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hmx3P42581 356 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fndc4Q3TR08 231 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nxt2Q3UNA4 142 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm826Q3UQ74 109 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thsd4Q3UTY6 1018 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Taar6Q5QD13 345 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 S100a15aQ6S5I3 108 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl35Q6ZWV7 123 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8BG31 207 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klk14Q8CGR5 250 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam169bQ8CHT6 337 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r211Q8R266 298 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1495Q8VEZ4 319 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cacng5Q8VHW4 275 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gjc3Q921C1 269 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sectm1aQ921W8 192 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem216Q9CQC4 141 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alkbh4Q9D8F1 300 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr951Q9EQ94 314 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Npas3Q9QZQ0 925 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc37a2Q9WU81 501 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Frem2Q6NVD0 3160 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr740E9PV79 311 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irf1P15314 329 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Id1P20067 168 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ceacam19Q3TQ88 271 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tex30Q3TUU5 225 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14851Q5ERJ0 116 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan7Q62283 249 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem230Q8CIB6 120 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Reep4Q8K072 257 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr460Q8VF31 314 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr340Q8VGL0 312 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Memo1Q91VH6 297 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vkorc1Q9CRC0 161 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asb5Q9D1A4 329 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtpO09113 325 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AccslQ3UX83 580 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr988Q7TRA1 309 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.9 ms