RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NLKQ9UBE8 527 aa20.98■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV24A0A0B4J272 114 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2QL1A1L167 161 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 DEGS1O15121 323 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 LHBP01229 141 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 GLAP06280 429 aa20.97■□□□□ 0.95
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF224P0DH78 156 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 Q8TCH9 128 aa20.97■□□□□ 0.95
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CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM21Q3B7S5 101 aa20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM221AA4D161 298 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNL4K9M1U5 179 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NAPSAO96009 420 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBP04435 133 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF735P0CB33 412 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HRH1P35367 487 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MEF2DQ14814 521 aa20.91■□□□□ 0.94
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