RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PRX2 142 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 J3QRE1 110 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 F2RL2O00254 374 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 MMP23AO75900 390 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 CRHBPP24387 322 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ACTA2P62736 377 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ACTG2P63267 376 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ACTC1P68032 377 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ACTA1P68133 377 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 RAB40BQ12829 278 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 REC114Q7Z4M0 266 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 MALSU1Q96EH3 234 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ZNF714Q96N38 554 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 CHST6Q9GZX3 395 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 DUSP21Q9H596 190 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 SCN3BQ9NY72 215 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.72□□□□□ -0.85
CTIF-208ENST00000590422 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 IRGMA1A4Y4 181 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PSPNO60542 156 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CHRM2P08172 466 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CALCBP10092 127 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 DUSP1P28562 367 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V1E1P36543 226 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 DYNLT3P51808 116 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SLC35A2P78381 396 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SGCDQ92629 289 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR4F4Q96R69 305 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CHST5Q9GZS9 411 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.71□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PTGES3LE9PB15 166 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SYT7O43581 403 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 ALX3O95076 343 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 HAND1O96004 215 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR2T7P0C7T2 308 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 DCKP27707 260 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 NPBWR2P48146 333 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR12D2P58182 307 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 LOXL3P58215 753 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 ST3GAL4Q11206 333 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 GRK1Q15835 563 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 AHSA2Q719I0 299 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 DTX3Q8N9I9 347 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 TMEM80Q96HE8 168 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SNX22Q96L94 193 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 JAM3Q9BX67 310 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.7□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 hADV38S2A0JD32 116 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 FAM172BPA6NC97 362 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 KRT8P05787 483 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CDK1P06493 297 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 IGLL1P15814 213 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 BCL3P20749 454 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 GABRR1P24046 479 aa9.69□□□□□ -0.86
CTIF-208ENST00000590422 CD24P25063 80 aa9.69□□□□□ -0.86
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