RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP69Q49AA0 526 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPNQ5VXI9 398 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM225Q6GV28 225 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.49□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM123Q8N131 208 aa3.49□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 CTRCQ99895 268 aa3.49□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 NEK6Q9HC98 313 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NRN1Q9NPD7 142 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MED11Q9P086 117 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COPZ2Q9P299 210 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 TCF19Q9Y242 345 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG2Q9Y698 323 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GY05 133 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF292O60281 2723 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PNV4 684 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PR80 420 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DHFRP00374 187 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OPN1LWP04000 364 aa3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF823P16415 610 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A1P30531 599 aa3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 ART1P52961 327 aa3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 POC1AQ8NBT0 407 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2M3Q8NG83 312 aa3.48□□□□□ -1.85
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