RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM172BP	A6NC97	362 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	EBAG9	O00559	213 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	LIMS3	P0CW19	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	LIMS4	P0CW20	117 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	GDNF	P39905	211 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	P2RX3	P56373	397 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	RAB40B	Q12829	278 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	AANAT	Q16613	207 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055		Q96MT0	163 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TMEM259-206	ENST00000589055	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MGST3	O14880	152 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MPZL2	O60487	215 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ALX3	O95076	343 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RBP4	P02753	201 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MT-ND2	P03891	347 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	HCK	P08631	526 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SOX2	P48431	317 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	EFNB2	P52799	333 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZP1	P60852	638 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SCN1B	Q07699	218 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MMP27	Q9H306	513 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TCF19	Q9Y242	345 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM212	A6NML5	194 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	VGLL3	A8MV65	326 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SULT1B1	O43704	296 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF44	P15621	663 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	GLIPR1	P48060	266 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ETV1	P50549	477 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	AES	Q08117	197 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZSCAN26	Q16670	478 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055		Q6P435	159 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	COQ2	Q96H96	371 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF702P	Q9H963	129 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055		A6NDX4	124 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	HSPB6	O14558	160 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SH2D1B	O14796	132 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM225B	P0DP42	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KIR2DS4	P43632	304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CDK5R1	Q15078	307 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	KISS1	Q15726	138 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	UTF1	Q5T230	341 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	NDNF	Q8TB73	568 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ORAI1	Q96D31	301 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	GLS2	Q9UI32	602 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	GABRP	O00591	440 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CCDC159	P0C7I6	412 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	CDK2	P24941	298 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	SLC34A1	Q06495	639 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TMEM259-206	ENST00000589055	HERPUD1	Q15011	391 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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