RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 MYOGP15173 224 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V0CP27449 155 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGDSP41222 190 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NPBWR2P48146 333 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RAC1P63000 192 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ID3Q02535 119 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35G3Q8N808 338 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM40LQ969M1 308 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB24Q969Q5 203 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SLAMF9Q96A28 289 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPSB4Q96A44 273 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NABP1Q96AH0 204 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ACY3Q96HD9 319 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 REEP6Q96HR9 211 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LYZL4Q96KX0 146 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IP6K3Q96PC2 410 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA5Q96QH8 159 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CHODLQ9H9P2 273 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC1BQ9P126 229 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RARRES3Q9UL19 164 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PP11 408 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PR64 198 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PRV1 198 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5H15A6NDH6 313 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5H1A6NKK0 313 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF212BA8MTL3 300 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 F5H5K5 113 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM250H0YL14 139 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MASP2O00187 686 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DVL1O14640 695 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD17B6O14756 317 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DEGS1O15121 323 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNAB3O43448 404 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CBR3O75828 277 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DKK1O94907 266 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF7P21781 194 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA3P26006 1051 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 APLNRP35414 380 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2B8PP59922 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RAC3P60763 192 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ELOBQ15370 118 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MSMO1Q15800 293 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX2Q16385 188 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NMSQ5H8A3 153 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRED2Q7Z698 418 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MKXQ8IYA7 352 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MR1Q95460 341 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SGCZQ96LD1 299 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DOK5Q9P104 306 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 VAX2Q9UIW0 290 aa6.7□□□□□ -1.34
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