RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF222Q9UK12 451 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HHLA2Q9UM44 414 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPE2 198 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PR64 198 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRV1 198 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MEIOCA2RUB1 952 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 BTBD17A6NE02 478 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 J3QRE1 110 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NPFFO15130 113 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL7O43827 346 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 KNG1P01042 644 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TK1P04183 234 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ISG15P05161 165 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CHRM2P08172 466 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MELTFP08582 738 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CALCBP10092 127 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GABRB1P18505 474 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MPZP25189 248 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCR9P51686 369 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 EDDM3BP56851 147 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 COL10A1Q03692 680 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RAB40BQ12829 278 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 KLRD1Q13241 179 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MKXQ8IYA7 352 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PNKDQ8N490 385 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM86BQ8N661 226 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N7P7 452 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NDNFQ8TB73 568 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SGCDQ92629 289 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PELI1Q96FA3 418 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CHIAQ9BZP6 476 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GLS2Q9UI32 602 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PTGES3LE9PB15 166 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RGS10O43665 173 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ALX3O95076 343 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-59P01825 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HCKP08631 526 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FBP1P09467 338 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GABRR1P24046 479 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP1P28562 367 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TGFBR2P37173 567 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2E1P51965 193 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC4P59998 168 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ERVK11-1P61568 191 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FDX2Q6P4F2 183 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 UTS2BQ765I0 119 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 Q8IYB0 196 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SYS1Q8N2H4 156 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MCFD2Q8NI22 146 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SETD6Q8TBK2 473 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RFT1Q96AA3 541 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SPSB1Q96BD6 273 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OPALINQ96PE5 141 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF747Q9BV97 191 aa6.82□□□□□ -1.32
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