RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR1Q1	Q15612	314 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GPR68	Q15743	365 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	GPAT4	Q86UL3	456 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	AKAP14	Q86UN6	197 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	UFD1	Q92890	307 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35B4	Q969S0	331 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	OR4C12	Q96R67	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	JAM3	Q9BX67	310 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RERGL	Q9H628	205 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	IL20	Q9NYY1	176 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CALML5	Q9NZT1	146 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	FBXL17	Q9UF56	701 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	WDR45	Q9Y484	360 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MSI2-216	ENST00000582772	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GABRP	O00591	440 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RGS5	O15539	181 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SPRY2	O43597	315 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HPGDS	O60760	199 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PTP4A3	O75365	173 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RGS11	O94810	467 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TPPP	O94811	219 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IGHG1	P01857	330 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HMGN1	P05114	100 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IFI30	P13284	250 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IRF2	P14316	349 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MYL12A	P19105	171 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A5	P22732	501 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TUBG1	P23258	451 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	NOS3	P29474	1203 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GABRA3	P34903	492 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	IFNGR2	P38484	337 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HTR3A	P46098	478 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LGALS4	P56470	323 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF85	Q03923	595 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	HES1	Q14469	280 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	P2RY14	Q15391	338 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DCST2	Q5T1A1	773 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	LNX2	Q8N448	690 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	OR52N1	Q8NH53	320 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	PTP4A1	Q93096	173 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RNF170	Q96K19	258 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	CEP19	Q96LK0	163 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD7	Q96MP8	289 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MSI2-216	ENST00000582772	FOXB1	Q99853	325 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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