RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPT2P23786 658 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MLXQ9UH92 298 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MEMO1Q9Y316 297 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCL2P13500 99 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTCP1P56278 107 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM268Q5VZI3 342 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2A2Q6IF42 318 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf123Q9NWV4 160 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM3AP98173 230 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLN3Q13286 438 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPA1Q15181 289 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.78■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARL6IP1Q15041 203 aa20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGCCQ9H4X1 137 aa20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DECR2Q9NUI1 292 aa20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.77■□□□□ 0.92
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SULT1A2P50226 295 aa20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTNL8Q6UX41 500 aa20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPSB1Q96BD6 273 aa20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.77■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf49A4QMS7 147 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED6O75586 246 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HEXAP06865 529 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM225BP0DP42 221 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTL6Q6ICC9 239 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q96M66 194 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TM4SF5O14894 197 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XRCC2O43543 280 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRASP01111 189 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FCGR3AP08637 254 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECI1P42126 302 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP57Q9NU63 452 aa20.76■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WISP2O76076 250 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CST4P01036 141 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERPINA5P05154 406 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD5P06127 495 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFYBP25208 207 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHEQ5VZ18 495 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P4HA3Q7Z4N8 544 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAXEQ8NCW5 288 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DOCK7Q96N67 2140 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIME1Q9H400 295 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.75■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANGPTL7O43827 346 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEDDO75618 318 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GABRR1P24046 479 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB13P51153 203 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB1AP62820 205 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BORCS8Q96FH0 119 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM157AC9JC47 383 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR8B8Q15620 311 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRRX2Q99811 253 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXL17Q9UF56 701 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.74■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9JQL5 133 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EPK0 472 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SFTA3P0C7M3 94 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM42Q69YG0 159 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIGCQ92535 297 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANXA10Q9UJ72 324 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRYQ5TBA9 3013 aa20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBP2P50120 134 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms