RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-GP17693 338 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 ATP6V0CP27449 155 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 PLGLAQ15195 96 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 SSX7Q7RTT5 188 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 CYC1P08574 325 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 COL19A1Q14993 1142 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 SIGLEC5O15389 551 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 OR7C2O60412 319 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-205ENST00000577827 KRASP01116 189 aa9.12□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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PTPRM-205ENST00000577827 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
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