RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	DEPP	Q9NTK1	212 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LUZP4	Q9P127	313 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	KPTN	Q9Y664	436 aa		15.9	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NCKAP5	O14513	1909 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF205	O95201	554 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DIRAS3	O95661	229 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CDS2	O95674	445 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PPY	P01298	95 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DANCR	P0C864	163 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	AADAC	P22760	399 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	GNMT	Q14749	295 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CALHM1	Q8IU99	346 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		15.89	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	AGPAT2	O15120	278 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	GLA	P06280	429 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SPP1	P10451	314 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CT55	Q8WUE5	264 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MPPED1	O15442	326 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR8U9	P0C7N5	309 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ACP1	P24666	158 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	FOXO1	Q12778	655 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PEA15	Q15121	130 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR8U1	Q8NH10	309 aa		15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	FAM157A	C9JC47	383 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	COX5B	P10606	129 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	RAB13	P51153	203 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	UCP2	P55851	309 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SPIN2A	Q99865	258 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LRFN1	Q9P244	771 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		15.87	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TK1	P04183	234 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PAX6	P26367	422 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	AVPI1	Q5T686	147 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	EXTL1	Q92935	676 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	FRYL	O94915	3013 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PINLYP	A6NC86	204 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SNCA	P37840	140 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NPBWR2	P48146	333 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CAMLG	P49069	296 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35G3	Q8N808	338 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A7	Q92504	469 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	BIN3	Q9NQY0	253 aa		15.86	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	FGF12	P61328	243 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	RND3	P61587	244 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD1	Q15116	288 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MIDN	Q504T8	468 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PSMF1	Q92530	271 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TP53RK	Q96S44	253 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	STRADB	Q9C0K7	418 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CTXN2	P0C2S0	81 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	GLI4	P10075	376 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NFYB	P25208	207 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF616	Q08AN1	781 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PRDX4	Q13162	271 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MPV17L	Q2QL34	196 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZPA2	131 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		15.85	■□□□□ 0.13

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