RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR176Q14439 515 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL13RA2Q14627 380 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NEDD8Q15843 81 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR8H2Q8N162 312 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHST4Q8NCG5 386 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MUL1Q969V5 352 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNX22Q96L94 193 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VCX3AQ9NNX9 186 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ING4Q9UNL4 249 aa10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HTR3BO95264 441 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2H2O95918 312 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FSHBP01225 129 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LMO1P25800 156 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP1P28562 367 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCGB2A2Q13296 93 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AWAT2Q6E213 333 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00596Q86U02 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OSR2Q8N2R0 312 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NANPQ8TBE9 248 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UPRTQ96BW1 309 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GHRLQ9UBU3 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STUB1Q9UNE7 303 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KPTNQ9Y664 436 aa10.64□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PQ09 198 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM82A0PJX8 343 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIRPB1O00241 398 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBBP0CG47 229 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD37P11049 281 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF2F2P13984 249 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF44P15621 663 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERPINA2P20848 420 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GABRR1P24046 479 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC22A6Q4U2R8 563 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6P435 159 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CMTM4Q8IZR5 234 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIRPDQ9H106 197 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFT22Q9H7X7 185 aa10.63□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PPH5 198 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MGST3O14880 152 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEGS1O15121 323 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC22A1O15245 554 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSPNO60542 156 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOX4O94842 621 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CSN2P05814 226 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MMP9P14780 707 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYL9P24844 172 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HTR2CP28335 458 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR3A1P47881 315 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMD7P51665 324 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRK1Q15835 563 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PIGYQ3MUY2 71 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM185AQ8N0U4 392 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDFY2Q96P53 400 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GFI1Q99684 422 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHST6Q9GZX3 395 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CST11Q9H112 138 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ONECUT1Q9UBC0 465 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.62□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0G2JK05 382 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PP11 408 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 M0R1W7 72 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC17A2O00624 439 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCD5O14737 125 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RANBP1P43487 201 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARF6P62330 175 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCN1BQ07699 218 aa10.61□□□□□ -0.71
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCD1Q15116 288 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms