RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 RASL12Q9NYN1 266 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TENM3Q9P273 2699 aa11.33□□□□□ -0.59
CS-231ENST00000552222 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SRMP19623 302 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 POU3F4P49335 361 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ZP1P60852 638 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GNB2P62879 340 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PDCD1Q15116 288 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MICBQ29980 383 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 DDI2Q5TDH0 399 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 LYPD6Q86Y78 171 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CDH26Q8IXH8 852 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SPICQ8N5J4 248 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SLAMF9Q96A28 289 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CEP19Q96LK0 163 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ZNF488Q96MN9 340 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 HES4Q9HCC6 221 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 A0A0U1RQK1 487 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MEGF11A6BM72 1044 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 A6NHS1 94 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ARL6IP5O75915 188 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CYB5AP00167 134 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 IGKV1D-12P01611 117 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MAS1P04201 325 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GLRA1P23415 457 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GMFBP60983 142 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 KCNJ8Q15842 424 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 STUMQ69YW2 141 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 REC114Q7Z4M0 266 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SATL1Q86VE3 508 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 Q8IYB0 196 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 STUB1Q9UNE7 303 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 C22orf46C9J442 243 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 F8VVB4 439 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 F8VWA3 439 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 K7EIL1 84 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NDUFA2O43678 99 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ANGPTL7O43827 346 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NXPH2O95156 264 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GYPAP02724 150 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TMEM225BP0DP42 221 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CD36P16671 472 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CPT2P23786 658 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PTGFRP43088 359 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NPBWR2P48146 333 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 ASCL4Q6XD76 172 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PXT1Q8NFP0 134 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 DYRK2Q92630 601 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PHF21AQ96BD5 680 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TBX15Q96SF7 602 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GPER1Q99527 375 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 NLKQ9UBE8 527 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 MIOXQ9UGB7 285 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 OR2AT4A6NND4 320 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 KDM4BO94953 1096 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 CD37P11049 281 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 PSG2P11465 335 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 AMY2BP19961 511 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 BCL3P20749 454 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 OR3A4PP47883 348 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 GPR157Q5UAW9 335 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 C22orf42Q6IC83 251 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-231ENST00000552222 BATF2Q8N1L9 274 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms