RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	ZP3	P21754	424 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ANOS1	P23352	680 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	MYL9	P24844	172 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ETV6	P41212	452 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	HCCS	P53701	268 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	FGF12	P61328	243 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ACTA2	P62736	377 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ACTG2	P63267	376 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	IL13RA1	P78552	427 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	PAX8	Q06710	450 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	WDR86	Q86TI4	376 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF573	Q86YE8	665 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	RNF141	Q8WVD5	230 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873		Q96MT0	163 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	GNG8	Q9UK08	70 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ING4	Q9UNL4	249 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	DAPL1	A0PJW8	107 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	PRR32	B1ATL7	298 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF879	B4DU55	563 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	C22orf46	C9J442	243 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	DVL1	O14640	695 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SYT7	O43581	403 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	TOX4	O94842	621 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	VENTX	O95231	258 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	APOL3	O95236	402 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	LHB	P01229	141 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	HTR1A	P08908	422 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	EGR1	P18146	543 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	GLRA1	P23415	457 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	CAPZA1	P52907	286 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	GMFB	P60983	142 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	EFNB1	P98172	346 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	PAX2	Q02962	417 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SCN1B	Q07699	218 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	BTN1A1	Q13410	526 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF273	Q14593	569 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	PDCD1	Q15116	288 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	STUM	Q69YW2	141 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	MOB3C	Q70IA8	216 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A28	Q96A46	364 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	C10orf35	Q96D05	121 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	RNFT2	Q96EX2	444 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	CCL13	Q99616	98 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	RASL12	Q9NYN1	266 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	NLK	Q9UBE8	527 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	KPTN	Q9Y664	436 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ACER3-213	ENST00000533873		A0A1W2PPH5	198 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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