RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 ASPHD2Q6ICH7 369 aa21.51■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 AHSA2Q719I0 299 aa21.51■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 DYRK2Q92630 601 aa21.51■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GHSRQ92847 366 aa21.51■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 CHST6Q9GZX3 395 aa21.51■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 hADV38S2A0JD32 116 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 MGST3O14880 152 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 RBP4P02753 201 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF728P0DKX0 622 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 LMO1P25800 156 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TAS2R43P59537 309 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 RPL15P61313 204 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 EDDM3AQ14507 147 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 PXT1Q8NFP0 134 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4S1Q8NGB4 309 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR51A2Q8NGJ7 313 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 NRG4Q8WWG1 115 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GPER1Q99527 375 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 SIRPB1O00241 398 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR2H2O95918 312 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ALDOBP05062 364 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 BMXP51813 675 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 YIF1BQ5BJH7 314 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 SATL1Q86VE3 508 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 FKBP14Q9NWM8 211 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 BTBD17A6NE02 478 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ERICH4A6NGS2 130 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 MYL12BO14950 172 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR3A1P47881 315 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 MTNR1BP49286 362 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 PPP3R1P63098 170 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ELP2Q6IA86 826 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZFP41Q8N8Y5 198 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 CHST4Q8NCG5 386 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 BEND2Q8NDZ0 799 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 PGLYRP3Q96LB9 341 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF714Q96N38 554 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF747Q9BV97 191 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM138Q9NPI0 162 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 LINC00312Q9Y6C7 94 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 DSCAML1Q8TD84 2053 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 POM121CA8CG34 1229 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GABRPO00591 440 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 AQP4P55087 323 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 WNT4P56705 351 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 Q499Y3 187 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TCF23Q7RTU1 214 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TPRX1Q8N7U7 411 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR13C5Q8NGS8 318 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 C1RLQ9NZP8 487 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 MMP24Q9Y5R2 645 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A0G2JK05 382 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR137BO60478 399 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF44P15621 663 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 COX7A1P24310 79 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 P2RX3P56373 397 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 SCN1BQ07699 218 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 TAF9Q16594 264 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 Q6P435 159 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 NANOGP1Q8N7R0 232 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 OR5R1Q8NH85 324 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A1B0GUS0 222 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 FUOMA2VDF0 154 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 DEGS1O15121 323 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 GPX5O75715 221 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 NDUFA7O95182 113 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 CD1AP06126 327 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV1-8P0DP01 117 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 OMGP23515 440 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 BDKRB2P30411 391 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 LGALS4P56470 323 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 RNLSQ5VYX0 342 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 ASCL4Q6XD76 172 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 OR13D1Q8NGV5 346 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4F5Q8NH21 305 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 C17orf50Q8WW18 174 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 AJUBAQ96IF1 538 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 MEGF9Q9H1U4 602 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 CKLFQ9UBR5 152 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 CDK1P06493 297 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 MDKP21741 143 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 PTGFRP43088 359 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 RAG2P55895 527 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 RIPK1Q13546 671 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 RSU1Q15404 277 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 DDI2Q5TDH0 399 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-217ENST00000527644 Q8NFD4 153 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms