RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	CD28	P10747	220 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	GLIPR1	P48060	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	CCR9	P51686	369 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZP1	P60852	638 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	AES	Q08117	197 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517		Q8N2B8	174 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517		A0A0G2JK05	382 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	MGST3	O14880	152 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZFPL1	O95159	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF20	P17024	532 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PRKACB	P22694	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	CD24	P25063	80 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	LMO1	P25800	156 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PEX2	P28328	305 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	P2RX3	P56373	397 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	GALE	Q14376	348 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517		Q6ZTK2	550 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	COQ2	Q96H96	371 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	MT-ND2	P03891	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	IL18R1	Q13478	541 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517		Q8IYB0	196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	CDK2	P24941	298 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	DYNLT3	P51808	116 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	SCN1B	Q07699	218 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	CORO2A	Q92828	525 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	S100A14	Q9HCY8	104 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	OPN1MW	P04001	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RRM2B-204	ENST00000517517	KISS1	Q15726	138 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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