RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	TXNDC12	O95881	172 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZP4	Q12836	540 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GGTLC2	Q14390	218 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR4F5	Q8NH21	305 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR6S1	Q8NH40	331 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR4F4	Q96R69	305 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NAA60	Q9H7X0	242 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR7C2	O60412	319 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADAM11	O75078	769 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PGA4	P0DJD7	388 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PGA3	P0DJD8	388 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CT45A6	P0DMU7	189 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CT45A5	P0DMU8	189 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CT45A7	P0DMV0	189 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GABRA1	P14867	456 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	DTYMK	P23919	212 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	COX7A1	P24310	79 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RAG2	P55895	527 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	UBE2G2	P60604	165 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FOXO1	Q12778	655 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRR7	Q8TB68	274 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ACY3	Q96HD9	319 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHST5	Q9GZS9	411 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ANK1	P16157	1881 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ESPL1	Q14674	2120 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF17	P17021	662 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NECAP1	Q8NC96	275 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF75A	Q96N20	296 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAB2	Q9UQC2	676 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00271	P0C7V0	271 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLC25A6	P12236	298 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	NPBWR1	P48145	328 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF787	Q6DD87	383 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SPIC	Q8N5J4	248 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	TAAR6	Q96RI8	345 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RASL12	Q9NYN1	266 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIAA1456	Q9P272	454 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF727	A8MUV8	499 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RECK	O95980	971 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR10J4	P0C629	311 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	FGF7	P21781	194 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	HFE	Q30201	348 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATP2C1-222	ENST00000514654	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.39	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms