RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 LOXL3P58215 753 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 UTS2BQ765I0 119 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TCF23Q7RTU1 214 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SPSB1Q96BD6 273 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 DAPL1A0PJW8 107 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 LEUTXA8MZ59 168 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SIRPB1O00241 398 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TOR1AO14656 332 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ENTPD6O75354 484 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP5HO75947 161 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PF4V1P10720 104 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CEACAM3P40198 252 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN1BQ07699 218 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2G2Q8NGZ5 317 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OPALINQ96PE5 141 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 HMG20AQ9NP66 347 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 IL36RNQ9UBH0 155 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PRX2 142 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 SNTNA6NMZ2 147 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ALX3O95076 343 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ISG15P05161 165 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 HTR1AP08908 422 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR3DL2P43630 455 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 PRRX1P54821 245 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF85Q03923 595 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 BNIP1Q12981 228 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZPA2 131 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZS46 218 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 HHLA2Q9UM44 414 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2H2O95918 312 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF44P15621 663 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK2P24941 298 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR3A1P47881 315 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 BDH1Q02338 343 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RFT1Q96AA3 541 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RHOFQ9HBH0 211 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CIB2O75838 187 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP23AO75900 390 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MNDAP41218 407 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ISL1P61371 349 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CD83Q01151 205 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 AESQ08117 197 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CORO2AQ92828 525 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF21AQ96BD5 680 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RNFT2Q96EX2 444 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 J3QLW9 94 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DYNC1I1O14576 645 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DEGS1O15121 323 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A6O15403 523 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM4BO94953 1096 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PF4P02776 101 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF19P17023 458 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CD24P25063 80 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LMO1P25800 156 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGFRP43088 359 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CCR9P51686 369 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FDX2Q6P4F2 183 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CHST4Q8NCG5 386 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MBOAT4Q96T53 435 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ING3Q9NXR8 418 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms