RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494512.1

MIS18BP1-208, Transcript of MIS18 binding protein 1, human

TSL 5

Gene MIS18BP1, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512		E9PI62	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SH2D1B	O14796	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	MAGEB3	O15480	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SULT1B1	O43704	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RBP4	P02753	201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ARG1	P05089	322 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	GRK1	Q15835	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ALX3	O95076	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CLIC3	O95833	236 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CD2	P06729	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	LIMS3	P0CW19	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	LIMS4	P0CW20	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	DUSP1	P28562	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RAB13	P51153	203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	IL18R1	Q13478	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ZNF146	Q15072	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	VCX	Q9H320	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	MGST3	O14880	152 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	PSPN	O60542	156 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	KDM4B	O94953	1096 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CSF1	P09603	554 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CALCB	P10092	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RAB3A	P20336	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	ETV1	P50549	477 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512		Q6ZTK2	550 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	GPER1	Q99527	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SIRPB1	O00241	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SOX2	P48431	317 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	KISS1	Q15726	138 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	SSX2	Q16385	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	CFHR4	Q92496	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIS18BP1-208	ENST00000494512	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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