RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 CPEP16870 476 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 LMO1P25800 156 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PTGFRP43088 359 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PPP3R1P63098 170 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PIGYQ3MUY2 71 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 USP43Q70EL4 1123 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 LHX4Q969G2 390 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 COQ2Q96H96 371 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 AJUBAQ96IF1 538 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 GFI1Q99684 422 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MGLLQ99685 303 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 OCEL1Q9H607 264 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 RHOFQ9HBH0 211 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 NEK6Q9HC98 313 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 IL36GQ9NZH8 169 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 A0A0G2JK05 382 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 A0A1W2PQ09 198 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 M0R1W7 72 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CYB5AP00167 134 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 UCHL1P09936 223 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CD37P11049 281 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TGFBR2P37173 567 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MTNR1BP49286 362 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 CAPZA1P52907 286 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FABP5Q01469 135 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 GPR50Q13585 617 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PDCD1Q15116 288 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SATL1Q86VE3 508 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SPARTQ8N0X7 666 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 UFD1Q92890 307 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM203Q969S6 136 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 MUL1Q969V5 352 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 SNX22Q96L94 193 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PPA2Q9H2U2 334 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR1A-207ENST00000483538 STAB1Q9NY15 2570 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 A0A0A6YYJ9 748 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 A0A0U1RQK1 487 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SHISA3A0PJX4 238 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C17orf98A8MV24 154 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MAS1P04201 325 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CSN2P05814 226 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 HSMCR30P0CW71 290 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GABRR1P24046 479 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PRTN3P24158 256 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SAA4P35542 130 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 P2RX3P56373 397 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 EDDM3AQ14507 147 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GRK1Q15835 563 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 UTF1Q5T230 341 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GPR157Q5UAW9 335 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM104Q8NE00 496 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C17orf50Q8WW18 174 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PHYHIPQ92561 330 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GPER1Q99527 375 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 KCNK15Q9H427 330 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CKLFQ9UBR5 152 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 RNF212BA8MTL3 300 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 HSPB6O14558 160 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms