RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478044.1

CUL2-208, Transcript of cullin 2, human

TSL 3

Gene CUL2, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL2-208	ENST00000478044	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MUL1	Q969V5	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MED30	Q96HR3	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	S100A13	Q99584	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PQ09	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SIRPB1	O00241	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HSPB6	O14558	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CRLF1	O75462	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GPX5	O75715	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HAND1	O96004	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	KNG1	P01042	644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ALDOB	P05062	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SRM	P19623	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HNF1A	P20823	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PCMT1	P22061	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GABRR1	P24046	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GABRA5	P31644	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	NPY4R	P50391	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZP1	P60852	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FGF12	P61328	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ARF6	P62330	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GPR50	Q13585	617 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		X6R8D5	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A087WXM4	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PP11	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PRD5	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PRF3	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PRM7	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A8MXK9	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CCRL2	O00421	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SH2D1B	O14796	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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