RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 CD69Q07108 199 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 FLOT2Q14254 428 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 C12orf73Q69YU5 71 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 BORCS8Q96FH0 119 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 CHST5Q9GZS9 411 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ACTB-209ENST00000473257 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.982e-27■□□□□ 8.5
ACTB-209ENST00000473257 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 METTL15A6NJ78 407 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZAR1LA6NP61 321 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HSPB6O14558 160 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 MGST3O14880 152 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR2F2O95006 317 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR2H2O95918 312 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 IGLV1-47P01700 117 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NFYBP25208 207 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 MTCP1P56278 107 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 BDH1Q02338 343 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HNF4GQ14541 408 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LTC4SQ16873 150 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 FGGYQ96C11 551 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 COQ2Q96H96 371 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KRT84Q9NSB2 600 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GNG8Q9UK08 70 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HHLA2Q9UM44 414 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PSMB11A5LHX3 300 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LINC01548A6NM66 108 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LY6LH3BQJ8 138 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ACTR3P61158 418 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF85Q03923 595 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 IL18R1Q13478 541 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF146Q15072 292 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR56B4Q8NH76 319 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ITFG2Q969R8 447 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ADI1Q9BV57 179 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HMG20AQ9NP66 347 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 POMPQ9Y244 141 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TENM2Q9NT68 2774 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPE3 182 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ODAMA1E959 279 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 LEUTXA8MZ59 168 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TOR1AO14656 332 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF44P15621 663 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ATF1P18846 271 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 BRS3P32247 399 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 RBP2P50120 134 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ATP1B3P54709 279 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 Q6P435 159 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 OSR2Q8N2R0 312 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 DRAM1Q8N682 238 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 TFAP2CQ92754 450 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 MNTQ99583 582 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 CIB1Q99828 191 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 B9D2Q9BPU9 175 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 NUDT19A8MXV4 375 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SH2D1BO14796 132 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 GYG2O15488 501 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 ATP8B1O43520 1251 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-209ENST00000473257 SERPINA3P01011 423 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms