RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461827.5

APOBEC3G-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3G, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-202ENST00000461827 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TEX37Q96LM6 180 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 WACQ9BTA9 647 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NTN4Q9HB63 628 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 FBN3Q75N90 2809 aa5.01□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 MEIOCA2RUB1 952 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GMNCA6NCL1 334 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NR5A2O00482 541 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 KCNAB3O43448 404 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 LY6HO94772 140 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 RAB36O95755 333 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 BCHEP06276 602 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 MSMBP08118 114 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 HSMCR30P0CW71 290 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CD79AP11912 226 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NR2C1P13056 603 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 BGNP21810 368 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GRPRP30550 384 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CDKN2CP42773 168 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NCALDP61601 193 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 VSNL1P62760 191 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PUDPQ08623 228 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 BNIP2Q12982 314 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PMS2P3Q13401 168 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 MS4A18Q3C1V0 323 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 LCE5AQ5TCM9 118 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TMEM53Q6P2H8 277 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF613Q6PF04 617 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OLIG3Q7RTU3 272 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CEACAM19Q7Z692 300 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 MDP1Q86V88 176 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SVOPLQ8N434 492 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 DHRSXQ8N5I4 330 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 C15orf54Q8N8G6 183 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OR6N1Q8NGY5 312 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OR5J2Q8NH18 312 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OR6X1Q8NH79 312 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 RASSF5Q8WWW0 418 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GTF2H4Q92759 462 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 MCUR1Q96AQ8 359 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF75AQ96N20 296 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OR2M2Q96R28 347 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 DGCR6LQ9BY27 220 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NOX3Q9HBY0 568 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 JMJD1CQ15652 2540 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 A0A1B0GWA3 101 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ACOD1A6NK06 481 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 M0R3G1 203 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 PLPP3O14495 311 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SNAP29O95721 258 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 IGF2P01344 180 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 HCKP08631 526 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF250P15622 560 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GPX2P18283 190 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CRYBB2P43320 205 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CDK6Q00534 326 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 IL18Q14116 193 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF146Q15072 292 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 OR1Q1Q15612 314 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC36A2Q495M3 483 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 C3orf56Q8N813 242 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 RAB1CQ92928 201 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 TIMD4Q96H15 378 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 GLTPQ9NZD2 209 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 SPATA2Q9UM82 520 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3G-202ENST00000461827 ABCA1O95477 2261 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms