RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	MYL12A	P19105	171 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DCK	P27707	260 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DLX6	P56179	175 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	MED21	Q13503	144 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ZNF146	Q15072	292 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	AANAT	Q16613	207 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TTC23	Q5W5X9	447 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375		Q6ZSV7	163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SETD9	Q8NE22	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	C17orf50	Q8WW18	174 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	GPER1	Q99527	375 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	C16orf95	Q9H693	158 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RHOF	Q9HBH0	211 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	HMG20A	Q9NP66	347 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	C8orf4	Q9NR00	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375		E9PI62	339 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TSPAN9	O75954	239 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CLPX	O76031	633 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	KDM4B	O94953	1096 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ALX3	O95076	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR2H2	O95918	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RAB3A	P20336	220 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PAX6	P26367	422 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	GABRA5	P31644	462 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SOX2	P48431	317 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	P2RX3	P56373	397 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PROK1	P58294	105 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RCN1	Q15293	331 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	KISS1	Q15726	138 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	FAM189A2	Q15884	450 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CCDC58	Q4VC31	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PLA1A	Q53H76	456 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ZNF691	Q5VV52	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SATL1	Q86VE3	508 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CITED1	Q99966	193 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ZNF649	Q9BS31	505 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	JAM3	Q9BX67	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375		H3BUI4	141 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	DEGS1	O15121	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PSPN	O60542	156 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CLIC3	O95833	236 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR3A1	P47881	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	MTNR1B	P49286	362 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ETV1	P50549	477 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	PPP3R1	P63098	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RSU1	Q15404	277 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SSX2	Q16385	188 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	ZNF626	Q68DY1	528 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR52W1	Q6IF63	320 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RNF144B	Q7Z419	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	NDNF	Q8TB73	568 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	GPR148	Q8TDV2	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	MALSU1	Q96EH3	234 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PARL-208	ENST00000450375	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23

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