RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ORAI1Q96D31 301 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF714Q96N38 554 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CITED1Q99966 193 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 HMG20AQ9NP66 347 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPE2 198 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PR64 198 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRV1 198 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 FAM172BPA6NC97 362 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ODF3BA8MYP8 253 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CHST1O43916 411 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MMP23AO75900 390 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 LALBAP00709 142 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MT-ND2P03891 347 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CCDC159P0C7I6 412 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZNF44P15621 663 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RAB13P51153 203 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 ZP1P60852 638 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CDK5R1Q15078 307 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TREML4Q6UXN2 200 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 RDH12Q96NR8 316 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 CLEC2DQ9UHP7 191 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-209ENST00000439106 hADV38S2A0JD32 116 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GABRPO00591 440 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 HSPB6O14558 160 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 MGST3O14880 152 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 CLPXO76031 633 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TMEM225BP0DP42 221 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TGFBR2P37173 567 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GDNFP39905 211 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GLIPR1P48060 266 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 AESQ08117 197 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 KISS1Q15726 138 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 FAM189A2Q15884 450 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 ZNF626Q68DY1 528 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 PIFOQ8TCI5 191 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 JAM3Q9BX67 310 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SH2D1BO14796 132 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN9O75954 239 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GNAO1P09471 354 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 P2RX3P56373 397 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SSX2Q16385 188 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 Q6P435 159 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SATL1Q86VE3 508 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TMEM219Q86XT9 240 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 COQ2Q96H96 371 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 C16orf95Q9H693 158 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 A0A0G2JK05 382 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 WIPF1O43516 503 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 RBP4P02753 201 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 RAB3AP20336 220 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 DCKP27707 260 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 OR3A4PP47883 348 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 DOC2BQ14184 412 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 UTF1Q5T230 341 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TTC23Q5W5X9 447 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GGHQ92820 318 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TMEM106AQ96A25 262 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 GPER1Q99527 375 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-209ENST00000439106 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms